灭活疫苗是将病原微生物(包括细菌、病毒和立克次体等)及其代谢产物用物理或化学的方法使其灭活，丧失毒力，但仍保留其免疫原性而制成的疫苗，如百日咳疫苗、流脑疫苗等。但是，灭活疫苗的稳定性好，容易保存。减毒活疫苗是将病原微生物(细菌和病毒)在人工条件下使其丧失致病性，但仍保留其繁衍能力和免疫原性，以此制成减毒活疫苗。
活苗使用剂量小免疲产生快。缺点有毒力返强，冷冻保存。灭活苗优点有：方便安全，容易保存。缺点：免疫期短，使用剂量大。
活疫苗。优点：1、类似自然感染过程，在机体内可复制增殖，免疫作用时间长，1次免疫可产生持久的免疫。2、免疫效果牢固，可形成局部和全身免疫。3、除注射接种(通常为皮下注射)外，可采取自然感染的途径(如口服、喷雾等)进行免疫。缺点：1、不稳定，不易于保存和运输；易受光和热影响。2、疫苗中可能污染不利的因子。3、受循环抗体、病毒等因素影响，所由干扰病原微生物在体内繁殖的因素，都可引起疫苗免疫失败。4、在体内由毒力返祖的潜在危险。5、免疫缺陷患者或正在接受免疫抑制治疗病人可引起严重或致命的反应。灭活疫苗。优点：1、稳定，易于保存和运输。2、不受循环抗体影响。3、安全性好，能杀灭任何可能污染的生物因子。缺点：1、在灭活过程中可能损害或改变有效的抗原决定簇，需多次注射，并要进行加强免疫。2、产生免疫效果维持时间短，不产生局部抗体。3、只能通过注射方式(通常为肌内注射)接种。