病猪轻微感染多不显症状而带虫，或出现轻微肠炎。严重感染，体温升高，下痢，便血；有时呕吐，食欲不振，迅速消瘦，半个月左右死亡，或者转为慢性。感染后，由于幼虫进入肌肉引起肌肉急性发炎、疼痛和发热，有时吞咽、咀嚼、运步困难和眼睑水肿，1个月后症状消失，耐过猪成为长期带虫者。
临床症状与旋毛虫感染多少和部位有关。被旋毛虫感染数量越多，症状越重。为肌旋毛虫。旋毛虫成虫寄生在猪小肠的肠壁上时，表现为体温升高、腹泻、疝痛、有时呕吐。旋毛虫幼虫寄生在猪的各横纹肌内时，表现为类风湿性肌肉疼痛，肌肉肿胀和硬结起，叫声嘶哑甚至无声，吞咽困难，重症感染最后死亡。
肠型旋毛虫对其胃肠的影响小，常常不显症状。肌旋毛虫的主要变化在肌肉，如肌细胞横纹消失、萎缩、肌纤维模增厚等。
