病菌主要以分生孢子和菌丝体在稻草和稻谷上越冬。翌年产生分生孢子借风雨传播到稻株上，萌发侵入寄主向邻近细胞扩展发病，形成中心病株。水稻稻瘟病是一种由真菌引起的“温暖潮湿”型病害，在菌源具备、品种感病的前提下，气象条件是影响病害发生与发展的主导因素。当温度在20℃-30℃，尤其在24℃-28℃，相对湿度保持在90%以上，稻株上水膜达到6～10小时，分生孢子最易萌发侵入，易引起稻瘟病严重发生。山区雾大露重，光照不足，稻瘟病的发生为害比平原严重。
田间管理不当，如放水早或长期深灌导致根系发育差，抗病力弱；偏施迟施氮肥，造成水稻旺长、贪青，抗病能力减弱；不合理的稻田灌溉，如长时间不排水或抽穗期缺水，均降低水稻抗病能力，易感染稻瘟病。稻瘟病为水稻产区的重点预防真菌性病害，以叶部、节部发生为多，造成穗颈瘟或节瘟发生严重，发病部位可从叶部拓展至根部导致白穗，引起减产达40%～50%，甚至颗粒无收。品种抗病性不同，在同一个种植环境下，有些品种对于稻瘟病的抗病性稍强，发病就会弱一些或者不发病，反之亦然。
