加强苗期消毒工作，避免感染病毒；喷施抗病毒药，增强抗性。控氮增钾，避免烟株徒长，增强烟株抵抗病毒能力。加强水分调节，避免干旱或者涝害，干旱或者涝害都会显着降低烟株对病毒的抵抗能力。加强田间卫生，出现病株及时拔除避免传染，田间烟叶残枝及时清除出烟田。及时消除蚜虫蓟马，出现蚜虫蓟马等害虫，尽快喷施农药避免传染。
选择抗病性好的烟叶品种，提高抗病虫害能力。合理轮作，配合深翻晒土、除杂草与改良土壤的方法来减少病害传染源。育苗用水必须清洁、无污染，基质、育苗盘、材料和棚内器物要严格消毒。剪叶工具要用漂白粉液浸泡消毒，在剪苗前喷抗病毒剂预防，间苗、定苗前要用肥皂洗手，避免交叉传染。科学追肥可以提高抗病性、减缓症状，病株要及时补充适量的速效氮肥、尿素、钾肥、锌肥以及微量元素。严防蚜虫，减少病害的传播。如发现蚜虫，立即用杀灭速度快的抗蚜威进行喷雾；或者可以采用覆盖银色地膜避蚜防病。苗期剪叶前喷施病毒抑制剂(菌克毒克、病毒必克等)来预防病害。栽后30天内用病毒必克+植病灵混合按比例兑水喷施三次，能有效控制花叶病的发生。
