西瓜蔓枯病危害茎蔓和叶片。西瓜叶枯病危害叶部。西瓜粘菌病危害靠近基部的叶片、根茎、叶片和果实。西瓜细菌性角斑病危害叶片、叶柄、茎、卷须及果实。西瓜斑点病和黑斑病危害叶片和果实。西瓜裂果症和果实腐斑病导致果实出现腐烂。其他病害包括西瓜枯萎病、炭疽病、病毒病、白粉病、叶斑病、疫病、根结线虫病和细菌性叶斑病。
病原以卵孢子在12~18厘米表土层越冬,并在土中长期存活。春天,遇有适宜条件萌发产生孢子囊,以游动孢子或直接长出芽管侵入寄主。再侵染主要靠病苗上产出孢子囊及游动孢子,借灌溉水或雨水溅射传播蔓延,病原侵入后,在皮层薄壁细胞中扩展,菌丝蔓延于细胞间或细胞内,后在病组织内形成卵孢子越冬。病菌生长适宜地温15~16℃,温度高于30℃受到抑制;适宜发病地温10℃,低温对寄主生长不利,但病菌尚能活动,尤其是育苗期出现低温、高湿条件,利于发病。猝倒病在土温10~15℃,湿度大或夜温很低,白天光照不足时病菌繁殖最快,温度在30℃以上则受到抑制或不发病。