叶鞘和和果穗苞叶上的病斑一般表现为纺锤形或不规则形，黄褐色，边缘紫黑色或不明显，病部往往密生一层灰黑色的霉状物，有时引起果穗腐烂或下垂掉落，种子发黑。
玉米小斑病在玉米整个生育期内都可发生，但以抽雄、灌浆期发病严重。主要为害叶片，但叶鞘、苞叶和果穗也能受害。在叶片上病斑较小，病斑数量多，在高温多湿条件下，病斑表面密生一层灰色的霉状物，即病原菌分生孢子梗和分生孢子。因玉米品种和病原菌生理小种不同，而表现为三种不同病斑类型：一是病斑椭圆形或近长方形，多限于叶脉之间，黄褐色，边缘褐色或紫褐色，多数病斑连片以后，病叶变黄枯死；二是病斑椭圆形或纺锤形，较大，不受叶脉限制，灰色或黄褐色，边缘褐色或无明显边缘，有的后期稍有轮纹，苗期发病时，病斑周围或两端形成暗绿色浸润区，病斑数量多时，叶片很快萎蔫死亡；三是病斑为黄褐色坏死小斑点，病斑一般不扩大，周围有黄色晕圈，表面霉层极少，通常多在抗病品种上出现。叶鞘和苞叶上病斑较大，纺锤型，黄褐色，边缘紫色或不明显，表面密生灰黑色霉层。果穗受害时，病部为不规则的灰黑色霉区，严重时，引起果穗腐烂，下垂掉落，种子发黑腐烂，影响发芽和出苗，常导致幼苗枯死。
玉米小斑病从苗期到成熟期均可发生，主要危害叶部，但茎部和果穗的苞叶、子粒也可被害。叶片病斑小而多，初为褐色水渍状小点，扩大后成椭圆形或长方形约0.5厘米的病斑，边缘有紫色或红色晕纹圈。
在潮湿的气候条件下，病斑上产生大量分生孢子，借气流传播，进行重复侵染，蔓延扩大，直到天气变冷，气温、湿度降低，不利于病原菌为止。
玉米小斑病常和大斑病同时出现或混合侵染，因主要发生在叶部，故统称叶斑病。发生地区，以温度较高、湿度较大的丘陵区为主。此病除危害叶片、苞叶和叶鞘外，对雌穗和茎秆的致病力也比大斑病强，可造成果穗腐烂和茎杆断折。其发病时间，比大斑病稍早。发病初期，在叶片上出现半透明水渍状褐色小斑点，斑点为椭圆形，较小，最长2厘米左右，边缘赤褐色，轮廓清楚，上有二三层同心轮纹。
