大豆与根瘤菌共生形成根瘤，能固定空气中的氮，每亩大都在生长良好的情况下可以固定6.4千克的氮，而每亩生产200千克的大所需要的氮是17.4千克，因而光靠大豆根瘤菌固氮是远不能满足大豆生长需要的。根瘤菌固氮对大豆是十分重要的，可是对根瘤菌固氮不能估计过高，所以种植大豆一定要施加一定量的氮肥。
大豆根瘤菌固定的氮素，不能满足其生长需要，单靠根瘤是不能获得高产。对地力瘠薄的地块和生育不繁茂的矮棵早熟品种大豆，需要施用氮肥。当肥力较高、水分充足的地块，或生育茂盛的中晚熟品种，可不施氮肥。
大豆苗期根瘤菌还未形成无固氮能力，生长需氮仍需靠施肥。快速生产需大量氮肥而根瘤菌固氮供氮能力有限仍需补氮。
