芹菜根腐病主要危害根部和茎基部。被侵害部位开始产生水浸状红褐色斑,几天后变为暗褐色或黑褐色,稍凹陷,叶片变黄,由下往上发展,但叶片不脱落。主根被害腐烂或坏死,侧根少。该病在芹菜的各生育期均可发生,感病初期,被害部位开始产生水浸状的红褐色病斑,随病情发展,病斑变为暗褐色或黑褐色,病部稍凹陷。植株地上部叶片由下往上开始变黄,但叶片不脱落。拔出病株后,可见主根已腐烂、坏死,侧根稀少,严重时整株枯死。芹菜、西洋芹苗期染病后,表现生长缓慢,当气温达到20℃以上时,叶色由绿变为黄绿色,致幼苗萎蔫或枯死。成株染病在高温季节叶片无光泽,叶色变暗淡,严重时叶片失绿或脉间叶肉出现黄绿相间斑驳,剖开病茎维管束变褐或根及根颈部、叶柄变为红色,根系腐烂致整株枯死。