春季高温多雨利于黑穗病发生和流行。宿根蔗田比新植蔗田发病重，宿根年限越长，发病越重。梢头苗做种地较整株做种地发病轻。施氮过多发病较重。
带菌土壤和宿根病蔗为初侵染源。厚垣孢子借气流、雨水、灌溉水和昆虫传播后落在蔗芽上藏在鳞片间，遇水萌发形成侵染菌丝侵入蔗芽，菌丝经暂时休眠后随蔗随蔗芽萌发而恢复活动并随生长点向上蔓延，生长点受病菌刺激初形成白色鞭状物至厚垣孢子形成时抽出黑色鞭状物，产生的厚垣孢子再经媒介传播落到蔗茎的侧芽上，刺激蔗芽萌发，使甘蔗抽出侧枝或分蘖并表成鞭状物。潜伏在蔗芽里的菌丝和落入土壤中的厚垣孢子成为下一季甘蔗的初侵染源。
甘蔗黑穗病发病条件：潜伏在蔗芽里的菌丝和落入土壤中的厚垣孢子成为下一季甘蔗的初侵染源。厚垣孢子萌发温限6～36℃，最适25～30℃。土壤潮湿时，孢子48小时内几乎全部萌发，萌发孢子不能及时遇上蔗芽时则很快死亡。厚垣孢子在干燥土壤中可存活数月至1年。冬春干旱利于孢子存活。春季高温多雨利于黑穗病发生和流行。宿根蔗田比新植蔗田发病重，宿根年限越长，发病越重。梢头苗做种地较整株做种地发病轻。施氮过多发病较重。
