水稻稻曲病可以用丙环唑，已唑醇，戊唑醇，氟环唑，苯醚甲环唑-丙环唑，咪鲜胺等加磷酸二氢钾加有机硅喷雾预防。
在发生稻曲病之后，需要及时的进行防治，可以使用咪鲜胺核吡唑醚菌酯，这种药物对于这种病害有很好的治疗效果。想要更好的起到治疗效果，在水稻破口之前的5-7天左右使用药物，效果会更佳，如果说用药时间太早，或者是用药太晚的话，都达不到效果。
稻瘟康为防治水稻稻曲病特效药。水稻从抽穗后至成熟期都可发生稻曲病，稻曲病常发期可以用稻瘟康300倍液喷雾稻田，重点喷药的部位是植株的上部，效果明显。还可以使用稻瘟康50毫升、大蒜油15毫升、水30斤，并添加适量渗透剂如有机硅等，混合均匀后进行全株喷雾，连续喷雾两次，间隔两天喷雾一次。
