冬瓜对土壤适应能力强，对土壤要求不高，各种土壤都能种植。但若在贫瘠的沙壤土当中，土壤营养不足就容易造成冬瓜矮小。另外由于冬瓜生长期长，有些农户为了追求产量大量使用化肥，使土壤容易浓度过高，有机质偏少，会使冬瓜植株难长好。建议农户减少化肥的用量，增施有机肥，提高土壤中的有机质含量。虽然冬瓜的病虫害不多，但冬瓜根线虫病同样会引致植株矮小、长不大。冬瓜根线虫病是由根线虫侵染而起。
在播种或定植时，喷淋1.8％齐螨素(阿维菌素类)乳油3000倍液或穴施10％力满库颗粒剂，每亩5千克，或5％力满库颗粒剂，每亩10千克，或3％甲基异柳磷颗粒剂，每亩施10~15千克，3％米乐尔颗粒剂，苗期每公顷1～1.5千克，成株期15～20千克，沟施。
