病菌可侵害多种蔬菜，田间病菌广泛存在，通过雨水、灌溉水及昆虫传播，由伤口侵入，引起发病。高温高湿条件下发病严重。高湿有利于病菌快速繁殖，潮湿或多雨瓜条伤口难以愈合，而有利于病菌侵染和传播。各种因素造成的伤口多，病害亦发生较重。
黄瓜软腐病是一种土传病害，可合并根腐病、根结线虫病一起发生，是导致黄瓜幼苗期死苗的比较常见的病害。病原菌在病残体上或土壤中越冬，经伤口或自然裂口侵入，靠接触传播蔓延，属于细菌性病害。越冬栽培模式下阴霾弱光高湿环境的棚室发生重。病菌在种子内、外和病残体上越冬，主要从叶片、掐须或瓜条的伤口、棚膜水滴下落、结露、叶片吐水、农事操作、雨水、昆虫、气流传播蔓延。发病温度范围在22～30℃，相对湿度80％以上均可促使细菌性病害流行。阴雨天气整枝绑蔓、掐须时损伤造成的叶片、枝干、幼嫩果实伤口均是病害大发生的重要因素。管理不当，病虫害侵害，土壤有细菌等原因也会导致病害发生。
种植黄瓜预防软腐病的危害，需要从根部做起，关注黄瓜生长防病的关键期。黄瓜出现烂根，通常是病理性烂根和生理性烂根两种情况，对于病理性烂根来说，通常是因为黄瓜镰刀菌根腐病和拟茎点霉根腐病引起的，在黄瓜田出现高温高湿、连作、地势低洼、土质黏重等情况时易发病。
