种子处理，播前用种子重量0.3％的50％琥胶肥酸铜可湿性粉剂，或72％农用硫酸链霉素可溶性粉剂，或3％中生菌素可湿性粉剂拌种。田间发现病株为害应及时施药，在发病初期可采用以下药剂进行防治：72％农用硫酸链霉素可溶性粉剂2000—4000倍液；47％春雷·氧氯化铜可湿性粉剂500—600倍液；88％水合霉素可溶性粉剂600—1000倍液；14％络氨铜水剂300—500倍液；50％氯溴异氰尿酸可溶性粉剂600—1000倍液；20％叶枯唑可湿性粉剂600—800倍液；20％噻菌茂可湿性粉剂800—1000倍液；12％松酯酸铜乳油600—800倍液；45％代森铵水剂400—600倍液；20％喹菌酮水剂1000—1500倍液；20％噻唑锌悬浮剂600—800倍液；20％噻森铜悬浮剂500—700倍液；喷雾，视病情隔7—10天l次。
防治辣椒细菌性叶斑病，与非茄科类蔬菜轮作二到三年，还用高垄栽培，覆盖地膜，及时排除田间积水，通风排湿，种子消毒，发病初期用77%氢氧化铜可湿性粉剂500倍液喷施防治，间隔七到十天，连续防治二到三次。
