第一，忌用生粪。施用腐熟有机肥，行冬灌、春灌，可加农药毒杀幼虫。第二，扒土晒根。多年生植株春天萌发前采用。第三，药剂防治。
韭菜灰霉病主要危害叶片，可采用噻菌灵烟剂或灭霉灵粉尘剂进行烟熏防治，韭蛆主要危害根茎，可采用菊马乳油或辛硫磷乳油进行喷施防治。
防治原则：按照“预防为主，综合防治”的方针，坚持以“农业防治、物理防治、生物防治为主，化学防治为辅”的无害化防治原则。农药不得施用国家明令禁止的高毒、高残留、高三致(致畸、致癌、致突变)农药及其混配农药。
因地制宜合理选择抗性品种；不施用未腐熟有机肥，均衡施肥；韭菜收割后可采取撒施草木灰、地面覆网或覆沙等阻隔措施减少韭蛆成虫产卵。
