苍术采用种子育苗，应选择颗粒饱满、色泽新鲜、成熟度一致的无病虫害的种子做种。苍术的种子属低温萌发型，发芽快，发芽势强，种子的吸水力高(达干种子的3～4倍)，田间出苗时间15天左右。播种前用25℃温水浸种，让种子充分吸足水分，严格掌握温度在10～20℃。待种子萌动、胚根露白，立即播种。春播以3月中旬至4月上旬为宜，每亩播种量4~5千克，分撒播和条播两种方式。撒播时，在畦面均匀撒上种子，覆细土2~3厘米；条播时，在畦面横向开沟，沟距20~25厘米，沟深3厘米左右；将种子均匀播于沟中，然后覆细土。播后上盖一层稻草或树枝，经常浇水保持土壤湿度，以利于种子萌发，出苗后去掉盖草或树枝。秋播可在11月中下旬进行。当苍术苗长到高3厘米左右时进行间苗，苗高10厘米左右即可移栽定植。移栽的行株距一般为30厘米x15厘米，栽后覆土压紧，浇水。阴雨天或午后定植容易成活。经研究发现，不同播种期其根茎生长无明显差异，但秋播发芽期和出苗期分别比春播者提前33天和25天，出苗率增加33.3%。苍术种子的萌发随温度的升高呈规律性变化，在5~10℃范围内，温度升高发芽率迅速增加，10℃达到最高值。发芽势也随温度升高而上升，15℃达到最大值。湿度充足，温度在5~15℃时，开始发芽，胚根首先突破种(果)皮，初露时呈鸟啄状，子叶肥厚，当其叶面展平的同时，主根下部发生多数侧根，然后后生叶由初生叶的叶鞘伸出，其下胚轴膨大成纺锤形根茎，并发生多数须根，进而子叶枯萎脱落。通过种子活力、发芽率测定，苍术种子为短命型。寿命只有半年，隔年种子在自然条件下保存不能使用。低温保存可延长种子寿命，苍术种子保存在低温下(0~4℃)，发芽率可保持在80%以上。