辣椒细菌性叶斑病病菌在种子和病残体上越冬。病菌在田间借风雨或灌溉水传播，从叶片伤口处侵入。当温湿度适合时，病株大批出现并迅速蔓延，否则很难找到病株，系非连续性为害。该病在雨后易发病，高温高湿条件下蔓延快。病菌可在种子及病残体上越冬，田间主要借助风雨及灌溉水传播，其次借助小昆虫活动或农事操作传播，远距离传播则通过种子。
地势低洼、管理不善、肥料缺乏、植株衰弱或偏施氮肥使植株徒长，发病严重。与甜(辣)椒、甜菜、白菜等十字花科蔬菜连作地发病重，雨后易见该病扩展。这种病害主要由丁香假单胞杆菌属细菌侵染引起，病菌会在种子及病残体上越冬，在田间可以借助雨水、灌水、昆虫、农具和农事操作近距离传播。高温、湿度大发病重，重茬地、排水不良、土地瘠薄或者缺肥发病重。当天气较冷后，病害会慢慢停止侵染或较缓慢扩展。东北及华北通常6月始发，7-8月高温多雨季节蔓延快，9月后气温降低，扩展缓慢或停止。
